Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ciao1Q99KN2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms