Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Apobec3Q99J72 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms