Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ubxn4Q8VCH8 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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