Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dnajc28Q8VCE1 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dnajc28Q8VCE1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Dnajc28Q8VCE1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Dnajc28Q8VCE1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Dnajc28Q8VCE1 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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