Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Samd4aQ8CBY1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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