Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
4933409G03RikQ8C5U0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4933409G03RikQ8C5U0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms