Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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