Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms