Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pnma8aQ80VM8 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pnma8aQ80VM8 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pnma8aQ80VM8 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pnma8aQ80VM8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pnma8aQ80VM8 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pnma8aQ80VM8 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pnma8aQ80VM8 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pnma8aQ80VM8 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Pnma8aQ80VM8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pnma8aQ80VM8 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms