Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssx9Q6XAS3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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