Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc88cQ6VGS5 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms