Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms