Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
AtminQ6P9S1 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms