Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Pkp4Q68FH0 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Pkp4Q68FH0 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pkp4Q68FH0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pkp4Q68FH0 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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