Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprdQ64487 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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PtprdQ64487 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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PtprdQ64487 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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PtprdQ64487 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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PtprdQ64487 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtprdQ64487 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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