Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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