Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms