Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms