Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Samd11Q1RNF8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms