Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rundc1Q0VDN7 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms