Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cdx4Q07424 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms