Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Siah1bQ06985 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms