Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
H3f3aP84244 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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