Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Irx1P81068 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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