Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Otx2P80206 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Otx2P80206 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Otx2P80206 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Otx2P80206 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Otx2P80206 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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