Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms