Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SbdsP70122 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms