Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms