Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Itga11P61622 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms