Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Sh3bp1P55194 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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