Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CntfP51642 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CntfP51642 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms