Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LtbrP50284 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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