Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Psen1P49769 AC131120.1-201ENSMUST00000217728 1617 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm11868-201ENSMUST00000121594 1478 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psen1P49769 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms