Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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PtpreP49446 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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