Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms