Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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