Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm14083-201ENSMUST00000117873 620 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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