Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TtrP07309 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TtrP07309 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
TtrP07309 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TtrP07309 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TtrP07309 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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TtrP07309 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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TtrP07309 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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TtrP07309 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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TtrP07309 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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TtrP07309 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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TtrP07309 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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TtrP07309 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TtrP07309 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TtrP07309 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TtrP07309 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TtrP07309 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TtrP07309 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TtrP07309 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TtrP07309 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TtrP07309 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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