Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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H2-Eb1P04230 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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