Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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