Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Gm17577J3QNF7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm17577J3QNF7 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms