Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrt4B2RU40 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms