Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Plcb2A3KGF7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Plcb2A3KGF7 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Plcb2A3KGF7 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Plcb2A3KGF7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Plcb2A3KGF7 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Plcb2A3KGF7 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Plcb2A3KGF7 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Plcb2A3KGF7 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Plcb2A3KGF7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Plcb2A3KGF7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Plcb2A3KGF7 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms