Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Lcn6A2AJB9 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Lcn6A2AJB9 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Lcn6A2AJB9 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Lcn6A2AJB9 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Lcn6A2AJB9 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Lcn6A2AJB9 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms