Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hdac5Q9Z2V6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hdac5Q9Z2V6 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms