Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SrfQ9JM73 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms