Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Dpp4-201ENSMUST00000047812 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Higd1aQ9JLR9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms