Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm8055-201ENSMUST00000099956 1008 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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