Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tlr5Q9JLF7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms