Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtofQ9ESF1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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